A integração fronteiriça dos países do Mercosul constitui-se objetivo permanente e eixo prioritário do FCCR. Nesse sentido, além de iniciativas próprias, o Foro vem incentivando ações dos países do bloco e de suas cidades e regiões com o intuito de promover o desenvolvimento integrado de seus territórios fronteiriços.

Em 2008, foram realizadas a Primeira Reunião do Grupo de Trabalho de Integração da Fronteira (GTIF) do FCCR e um Seminário sobre Integração Fronteiriça, ambos em Formosa, Argentina, com o objetivo de contribuir para o fortalecimento e consolidação do Mercosul, por meio da discussão dos problemas fronteiriços a partir das perspectivas e necessidades desses territórios.

Nesses dois eventos discutiram-se diversos aspectos relacionados aos problemas das zonas fronteiriças e foi levantada a necessidade de que cada Coordenação Nacional do FCCR identifique e mobilize as áreas de cada governo nacional que lida com questões de fronteira, tendo em vista a formulação de ações articuladas de integração.